В годы Великой Отечественной войны школа располагалась в одноэтажном деревянном здании на углу улиц Вокзальная (Станционная) и Кирова. Заведовала начальной школой Козьминых Нина Константиновна. В школе было 17 классов и более 700 человек. Но все они, и учителя, и ученики, жили одной большой семьей с общими горестями и заботами.
В школе работал женский коллектив, на чьи хрупкие плечи легли все тяготы военной жизни. Работали в те годы Князева Варвара Тимофеевна, Михальчук Раиса Ивановна, Салабаева Зоя Иосифовна, Савицкая Александра Петровна, Жилова Анна Ивановна, Попова Олимпиада Степановна, Емельянова Екатерина Константиновна, Нестерова Екатерина Николаевна, Карельцева Наталья Федоровна, Величутина Александра Тимофеевна и другие учителя.
Учителей в годы войны объединяло одно стремление: сделать все, чтобы ребятишки были в тепле, были накормлены и учились, несмотря на потери и трудности. Почти в каждой семье кто-то воевал, а те, кто остался дома, день и ночь работали на благо страны. Дети были предоставлены сами себе, поэтому учителя задерживались после уроков, занимаясь с детьми. Денег на питание ребят выделялось мало, и учителя организовывали для них горячие завтраки на собственные средства. Всей школой выращивали овощи на своем огороде за Тоболом, который находился примерно напротив пляжа «Бабьи пески». Каждую весну всем коллективом сажали, а затем поливали, пололи, и осенью на тележках или на руках переносили урожай в школу.
Кроме того, учителя заготавливали дрова на зиму, т.к. школа отапливалась печами. Получив деляну в лесу, сами валили лес, рубили сучья, а вечером, усталые, но с шутками и смехом, возвращались домой. В школе оставалась одна Варвара Тимофеевна Князева, самая старшая из учителей.
Горе потери дорогих людей коснулось и учителей; погиб муж у Величутиной Александры Тимофеевны, погибли сыновья у Князевой Варвары Тимофеевны и Жиловой Анны Ивановны, тяжело был ранен муж у Белкиной Галины Борисовны. И только в школе среди своих коллег и учеников старались утешить свое горе учителя.
Приближался Новый год, дети уже ушли на каникулы, разошлись под вечер домой и учителя.
Из воспоминаний Козьминых Нины Константиновны: «Мне хотелось хоть как-то чуть-чуть согреть сердца своих коллег, дать им почувствовать, что они не одиноки. И вот мы вместе с местным комитетом с разрешения ОРСа получили немного продуктов. 31 декабря развесили в маленькие кулечки по 200 г муки, 200 г сахара и 50 г масла и вместе с теплыми словами поздравления разнесли вечером каждому работнику школы. Учителя радовались этому подарку, как дети!».
Когда появилась в продаже книга Аркадия Гайдара «Тимур и его команда» во многих городах и поселках необъятной России стали образовываться тимуровские отряды из октябрят, пионеров, комсомольцев. Екатерина Константиновна Емельянова – старшая пионервожатая с 1935 г. по 1942 г. – стала лидером первой такой команды в г. Кургане. Она вспоминала: «Когда началась война, ребята стали помогать женщинам, проводившим мужей на фронт и оставшихся с грудными детьми на руках; таскали воду, ходили за хлебом, присматривали за малышами. В школе № 28 образовался госпиталь, в котором тимуровцы ухаживали за ранеными солдатами, которых затем отправляли во все госпитали нашей страны».
Для Екатерины Константиновны этой тимуровской работы было мало, она хотела защищать Родину на военных фронтах. 5 мая 1942 года 18-летняя девушка подала заявление в партотдел с просьбой взять её на фронт. Спустя 2 недели пришла повестка. Отправили Катю не туда, куда она хотела, не на фронт, а отправили на службу во ВНОС (воздушное наблюдение, оповещение, связь). В войсках ВНОС Екатерина Константиновна прослужила до конца войны.
Из воспоминаний Козьминых Нины Константиновны: «Однажды позвонили в школу и предложили освободить меньшее здание от парт. Ждали детей из Ленинграда. За несколько часов учителя побелили, вымыли, натопили это здание. Пришел эшелон. Детей, обессиленных и больных, привозили со станции на подводах. Сердце сжималось от боли, когда мы увидели этих исхудавших, окаменевших от горя, детей. А наутро в школе снова начались занятия, но уже в три смены. Тесно было в школе. Ведь во всех домах, которые окружали школу, жили эвакуированные, приехавшие сюда с детьми. В одном доме жило несколько семей. И все эти ребята ходили в нашу школу. Так, в сентябре 1941 года пришел в нашу школу мальчик, чисто и непривычно красиво одетый. Отец, мать и сестра приехали сюда из Москвы. Два года учился он в нашей школе».
Много лет спустя он вспомнит об этом в рассказе «Мое первое стихотворение». Потом были ещё и ещё стихи. Так родился один из известных поэтов прошлого века: Андрей Андреевич Вознесенский.
Чашникова Роза пришла в первый класс в нашу школу, как и Андрей Вознесенский, в 1941 году – в год начала войны. Позднее она вспоминала: «Школа была деревянная, одноэтажная барачного типа. В классе было 29 учеников. Классным руководителем была Наталья Федоровна Карельцева. Мы её очень любили, она была для нас второй мамой. Она никогда не повышала на нас голос. Всем классом ходили на вокзал провожать её брата на фронт. В большом узком зале смотрели, сидя на полу, кинофильмы «Они защищали Родину», «Разгром немецких войск под Москвой», плакали и боялись, что танк как бы на нас шел».